2002年3月14日，中央编办复字【2002】51号文批复，将原中国合格评定国家认可中心和原国家出入境检验检疫局进出口评定中心（中国进出口评定认可中心）合并为中国合格评定国家认可中心，核定事业编制138名，经费自理。2002年8月20日，中国合格评定国家认可中心在人民大会堂宣告成立。

　　领导班子

　　2002年至2004年，刘卓慧(兼)、刘欣、生飞、樊恩健、魏昊。

　　2004年至2008年，肖建华、刘欣、樊恩健、魏昊。

　　2008年至今，     肖建华、刘欣、樊恩健、宋桂兰。

　　内设机构

　　2002年4月5日，经中共国家认证认可监督管理委员会党组会议研究，同意中国合格评定国家认可中心设置综合管理部、认证机构认可部（对外称中国国家认证机构认可委员会秘书处）、实验室认可部（对外称中国国家实验室认可委员会秘书处）、认证人员培训认可部（对外称中国国家认证人员培训认可委员会秘书处）。其中综合管理部内设办公室、人事处、财务处；认证机构认可部内设认可一处、认可二处、认可三处、技术处、监督管理处；实验室认可部内设业务管理处、认可评审处、评审员处、研究开发与能力验证处；认证人员培训认可部内设培训认可处、人员注册处、业务发展处。

　　2002年12月20日，在认证人员培训认可部增设并组建“人员注册二处”,同时将原“人员注册处”更名为“人员注册一处”。

　　2002年12月17日，经国家认证认可监督管理委员会临时机关党委研究决定，同意成立中国合格评定国家认可中心团支部。

　　2003年1月8日，经国家认证认可监督管理委员会工会研究决定，同意中国合格评定国家认可中心成立职工工会委员会。

　　2003年6月30日，经国家认证认可监督管理委员会党组同意，中国合格评定国家认可中心成立党委。

　　2005年7月21日，经国家认证认可监督管理委员会研究同意，中国合格评定国家认可中心成立科技服务有限公司。

　　2005年12月7日，经国家认证认可监督管理委员会党组会议研究，同意中国合格评定国家认可中心撤销内设的综合管理部、认证机构认可部、人员培训认可部和实验室认可部。内设机构调整为办公室、人事处、财务处、综合业务处、认证机构处、实验室处、检查机构处、能力验证处、评定处、评审员处、技术处、国际合作处、质量处和督查处等14个职能处室。

　　2005年12月7日，经国家认证认可监督管理委员会党组会议研究，同意将中国合格评定国家认可中心人员注册与培训认可部（即CNAT秘书处）承担的职能划归“认证认可协会”（以下简称“协会”），中心不再承担上述工作，相应机构撤销。

　　2007年1月25日，经中共国家认证认可监督管理委员会党组会议研究，同意中国合格评定国家认可中心设立党委办公室。

　　2009年9月23日，中国合格评定国家认可中心纪委成立。

　　2011年7月29 日，经国家质检总局党组会研究，批准《中国合格评定国家认可中心主要职责、内设机构和人员编制规定》，中国合格评定国家认可中心设立办公室、综合业务处、认可一处、认可二处、认可三处、认可四处、认可五处、认可六处、认可七处、评审员处、技术处、国际合作处、质量处、人事处、财务处和党委办公室（监察室）16个内设机构。

　　工作人员

　　信息化建设

　　2006年7月10日，CNAS中文网站开通并正式运行。10月开通英文网站。

　　2007年9月，启动新CNAS业务管理系统的整合和开发工作。

　　2008年10月，认证机构认可业务管理系统正式启用。

　　2010年9月，在认证机构认可业务领域推行电子档案管理系统。

　　2010年12月，办公自动化系统初步建立。 

　　宣传工作

　　2008年6月9日，利用首个国际认可日机会，印发国际组织和中方致辞，通过新闻媒体等广泛开展了集中的宣传活动。

　　2009年6月9日，为庆祝第二个“国际认可日”，国家认证认可监督管理委员会、中国合格评定国家认可委员会、中国认证认可协会联合举办了“认证认可与质量安全暨国际认可日·中国论坛”，由中国合格评定国家认可委员会具体承办。此次论坛规模大、规格高、与会方众多，是中国认可事业发展历程中一次重要的会议。

　　2010年6月6日，在人民大会堂举行了第三个世界认可日-中国论坛宣传活动，体现出规格高、范围广、影响大的特点。6月9日前后，全国有24个省/市/自治区/直辖市的质检部门举办了相关活动，覆盖了中国大部分行政区域。相关宣传报道网页约2.8万多篇，成为推动认可工作、宣传认可价值的重要平台。

　　2011年6月9日，由国家质检总局、国家认监委、上海市人民政府主办，中国合格评定国家认可委员会、上海市质量技术监督局、上海出入境检验检疫局承办，中国认证认可协会、认证认可技术研究所协办的“世界认可中国日”主题活动在上海成功举办。

　　文化建设

　　2011年5月18日，正式启动“文化建设提升活动”。

　　2012年1月11日，发布《中国合格评定国家认可中心组织文化手册》。

　　党建工作

　　2005年4至6月，开展了保持共产党员先进性教育活动。

　　2008年10月至2009年3月，开展了深入学习实践科学发展观活动。

　　2010年10月起，开展创先争优活动。

　　精神文明建设

　　2005年至2011年，连续七年获中央国家机关精神文明先进单位称号

　　公益活动

　　2005年8月25日，中国合格评定国家认可中心与科左后旗满斗小学签署共建协议，学校正式更名为满斗认可希望小学。

　　2008年7月，中国合格评定国家认可中心为甘肃省陇南市甘泉中认小学捐款50万元。

　　中国合格评定国家认可中心积极组织职工开展为汶川抗震救灾、玉树抗震救灾，南方冰雪灾害和贫困地区捐款捐物活动，累计捐款50余万元。

　　办公地点

　　2002年4月至2004年2月，北京市朝阳区和平里西街甲2号

　　2004年2月至2008年12月，北京市朝阳区朝外大街甲10号

　　2008年12月，北京市东城区南花市大街8号